Introducción: El virus del papiloma humano (VPH) es la infección de transmisión sexual más común, con genotipos de alto riesgo como el VPH-16 y VPH-18 asociados a cáncer cervicouterino. Objetivo: Analizar la interacción de los factores de riesgo y coinfecciones en mujeres con antecedentes de Papanicolau negativo y positividad al VPH, estratificadas por genotipo. Métodos: Se realizo un estudio descriptivo en el municipio Santa Clara, Villa Clara en 174 mujeres positivas al VPH y antecedentes de Papanicolau negativos, entre el 2020 hasta el 2024; donde se evaluaron variables como edad de inicio sexual, número de parejas, uso de condón, anticoncepción hormonal, antecedentes de ITS y coinfecciones bacterianas/fúngicas. Se realizó un análisis de correlación (χ² y odds ratio, OR) y análisis de regresión logística para factores asociados a VPH-16/18 vs. otros genotipos. Resultados: El VPH-16 y VPH-18 mostraron mayor asociación con inicio sexual temprano (<15 años), múltiples parejas (>5), uso de anticonceptivos orales y la infección por chlamydia trachomatis. Conclusión: Los genotipos 16 y 18 presentan perfiles epidemiológicos distintivos, con mayor riesgo vinculado a conductas sexuales tempranas y coinfecciones.